| Registro completo |
| Provedor de dados: |
Acta biol.Colomb.
|
| País: |
Colombia
|
| Título: |
CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DEL Potato virus V (PVV) INFECTANDO Solanum phureja MEDIANTE SECUENCIACIÓN DE NUEVA GENERACIÓN
|
| Autores: |
ÁLVAREZ YEPES,Daniela
GUTIÉRREZ SÁNCHEZ,Pablo Andrés
MARÍN MONTOYA,Mauricio
|
| Data: |
2016-09-01
|
| Ano: |
2016
|
| Palavras-chave: |
DAS-ELISA
NGS
Papa
Potyvirus
RT-qPCR
|
| Resumo: |
Las enfermedades virales son uno de los problemas más limitantes para la producción de papa en el mundo. Uno de los materiales de papa más susceptibles a los virus corresponde a Solanum phureja; sin embargo, en Colombia son pocos los estudios adelantados sobre los agentes causales que lo afectan. En este trabajo se realizó una caracterización molecular del Potato virus V (PVV) infectando plantas de S. phureja en Antioquia, utilizando métodos de secuenciación de nueva generación (NGS), pruebas de DAS-ELISA, RT-PCR en tiempo real (RT-qPCR) y RT-PCR convencional. Los resultados indican la ocurrencia de niveles muy variables de incidencia del virus entre lotes de cultivo (6,7 % a 86 %). El PVV tiene un genoma de 9828 nt que codifica para una poliproteína de 3066 aa y presenta dos variantes principales (Var_A y Var_B) en proporciones de 72 y 28 %. Estas variantes comparten altos niveles de identidad genética (99,7 % en todo el genoma) entre ellas y con respecto a la cepa PVV-Phureja reportada en Colombia, pero no con otras cepas del mundo (82-83 %). Con base en dichos genomas, se diseñaron y evaluaron en muestras foliares de S. phureja, dos pares de cebadores para la detección del virus en pruebas de RT-PCR (459 pb) y RT-qPCR (89 pb, Ct=12,08-21,86 y Tm= 78,7°C-80,2 °C), confirmándose la presencia de este virus en tejidos sintomáticos y asintomáticos de papa criolla. La ocurrencia generalizada de PVV en los cultivos de S. phureja indica la necesidad de incorporar en los programas de certificación de tubérculos-semilla de S. phureja en Colombia el diagnóstico de este virus.
|
| Tipo: |
Info:eu-repo/semantics/article
|
| Idioma: |
Espanhol
|
| Identificador: |
http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2016000300007
|
| Editor: |
Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología
|
| Relação: |
10.15446/abc.v21n3.54712
|
| Formato: |
text/html
|
| Fonte: |
Acta Biológica Colombiana v.21 n.3 2016
|
| Direitos: |
info:eu-repo/semantics/openAccess
|
|
